Биохимия - Химические реакции в живой клетке Том 2 - Д. Мецлер 1980

Организация метаболизма: катаболические пути
Окисление жирных кислот

Метаболизм включает в себя необозримое множество различных химических реакций. Многие из них организованы в сложные циклы, в которых иногда трудно разобраться. Однако имеются здесь и логика, и порядок. За небольшим исключением, метаболические пути складываются из последовательно идущих реакций, описанных в гл. 7, 8 и 10 (и подытоженных в табл. 9-1), и каждая такая цепь реакций организована для выполнения определенной химической задачи.

В этой главе мы проанализируем некоторые из основных путей катаболизма питательных веществ и клеточных компонентов. Реакции анаболизма (биосинтеза) будут рассматриваться в последующих главах.

При сгорании углеводородов выделяется значительно больше энергии, чем при сгорании большинства других органических соединений, и неудивительно, что жиры, являющиеся основной формой запасания питательных веществ в организме, имеют в основном углеводородную природу. С энергетической точки зрения наибольшее значение имеют жирнокислотные компоненты. Большинство аэробных клеток способно к полному окислению жирных кислот до СО2 и воды в результате процессов, протекающих в матриксе митохондрий эукариотических клеток.

Местом химической атаки служит окисленный конец жирной кислоты. В качестве первой стадии осуществляется «Пусковая реакция», в ходе которой жирная кислота через последовательность химических превращений S1A(а) [см. табл. 7-2 — Ред.] переходит в форму водорастворимого ацил-СОА-производного — соединения, в котором «активированы» а-водороды жирнокислотных радикалов [уравнение (9-1)]:

Эта реакция катализируется ацетат-тиокиназой [уравнение (7-30)] и другими ацил-СоА — синтетазами — ферментами, активирующими жирные кислоты. Имеется по меньшей мере два типа таких ферментов; одни из них специфичны к углеродным цепям средней длины (от 4 до 12 атомов углерода), другие же — к более длинным цепям. Митохондрии также содержат ацил-СоА — синтетазы [1], способные расщеплять GTP до GDP и Pi — в этом случае осуществляется последовательность реакций SlA(y).

Основные типы метаболических реакций

Реакция

Таблица (страница)

Рисунок

Текст (страница)

1. Нуклеофильное замещение

88


91

А. У —CH2Y



93

Б. У — СО—Y

192


103

В. У атома фосфора



115

Г. У атома серы



139

S1. Последовательное замещение у Р и С, часто сопровождаемое расщеплением АТР. Используется в синтезе эфиров, амидов, тиоэфиров, а также при фосфорилировании на субстратном уровне

136


132

2. Присоединение




А. К С = О или C = N

88


140

Б. К С = С



145

3. Элиминирование




А. С образованием С = О или C = N



140

Б. С образованием С = С



145

В. С декарбоксилированием

4. Образование енолят-анионов и енаминов и их участие в реакциях изомеризации

89

7-9

153

154

5. Енолят-анионы в роли нуклеофилов

89


160

А. Замещение у С = О



162

S 5A. Биотинзависимое карбоксилирование

195


194

Б. Присоединение по С = О (альдольная конденсация)


7-10

7-11

162

В. Присоединение к СО2(ß-карбоксилирование)



170

6. Некоторые структурные перегруппировки 7. Тиаминзависимое а-расщепление

S7A. Синтез

90

8-3

176

201

АТР с участием фосфокетолазы


8-4

206

S7B. Окислительное декарбоксилирование а-кетокислот


8-19

268

S7C. Реакция с участием пируват-формиат-лиазы


8-19

274

8. Реакции шиффовых оснований пиридоксаль-фосфата


8-6, 8-7

209

9. Реакции переноса водородов и электронов

239, 257


237

A. NAD+- и NADP+-зависимые

239

8-10

240

Б. Флавинзависимые

257

8-14

253

В. Липоатзависимые


8-18

268

Г. Реакции железо-серных белков


(10-4)—(10-6)

379

Д. Реакции хинонов


10-8

383

Е. Реакции цитохромов


10-3

373

Ж. Селензависимое дегидрирование



331

S9C. Образование АТР, сопряженное с окислением альдегида


8-13

246

10. Витамин В12-зависимые реакции

290


283

Реакции изомеризации



292

Реакции, катилизируемые рубоиуклеотидредуктазой



294

Реакции переноса метильиой группы



296

11. Гидроксилирование

Реакции с участием диоксигеназ



435

Реакции с участием моноксигеназ (гидрокси- лаз)



436

Флавинсодержащих

Птеридинозависимых



437

438

Кетоглутаратзависимых



440

Аскорбатзависимых



441

Цитохром P-450-зависимых



443

12 Реакции с перекисями




Окислительное декарбоксилирование



273

С участием глутатионпероксидазы



370

13. Реакции с участием фолиевой кислоты

281

8-20, 8-21

275