Основы биоинформатики - Огурцов А.Н. 2013

Список литературы

Основная

1. Огурцов А.Н. Введение в биоинформатику / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2011.-208 с.

2. Огурцов А.Н. Методы биоинформационного анализа / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2011.-114 с.

3. Огурцов А.Н. Информационная биотехнология и фармакоинформатика/А.Н. Огурцов. -X. : НТУ "ХПИ", 2012. - 160 с.

4. Огурцов А.Н. Бионанотехнология. Принципы и применения / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2012. - 480 с.

5. Огурцов А.Н. Научные исследования и научная информация / А.Н. Огурцов, О.Н. Близнюк. -X. : НТУ "ХПИ", 2011.-400 с.

6. Огурцов А.Н. Основы молекулярной биологии : в 2-х ч. - Ч. 1. Молекулярная биология клетки / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2011. - 304 с.

7. Огурцов А.Н. Основы молекулярной биологии : в 2-х ч. - Ч. 2. Молекулярные генетические механизмы / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2011.-240 с.

8. Огурцов А.Н. Введение в биофизику. Физические основы биотехнологии / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2008. - 320 с.

9. Огурцов А.Н. Молекулярная биофизика и ферментативный катализ / А.Н. Огурцов.-X. : НТУ "ХПИ", 2011. - 400 с.

10. Огурцов А.Н. Молекулярная биотехнология. Фундаментальные и прикладные аспекты / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2012. - 432 с.

11. Огурцов А.Н. Биологические мембраны / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2012.-368 с.

12. Огурцов А.Н. Нанобиотехнология. Основы молекулярной биотехнологии / А.Н. Огурцов. - X. : НТУ "ХПИ", 2010. - 384 с.

13. Огурцов А.Н. Физико-химические основы биотехнологии. Биотермодинамика / А.Н. Огурцов, О.Н. Близнюк. - X. : НТУ "ХПИ", 2011. - 256 с.

14. Berg J.M. Biochemistry / J.M. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer. - New York : W.H. Freeman and Company, 2012. - 1224 p.

15. Boisover S.R. Cell biology. A short course / S.R. Boisover, J.S. Hyams, E.A. Shephard et al. - Hoboken : Wiley, 2004. - 531 p.

16. Computational toxicology: Risk assessment for pharmaceutical and environmental chemicals / Ed. by S. Ekins. - Hoboken : Wiley, 2007. - 814 p.

17. Finkeistein A.V. Protein physics / A.V. Finkeistein, O.B. Ptitsyn. - London : Academic Press, 2002. - 354 p.

18. Orry A. J.W. Homology modeling. Methods and protocols / A.J.W. Orry, R. Abagyan. - New York : Humana Press, 2012. - 432 p.

19. Ignacimuthu S. Basic bioinformatics / S. Ignacimuthu. - New Dehli : Narosa Publishing House, 2006. - 206 p.

20. Lesk A.M. Introduction to Bioinformatics / Lesk A.M. - Oxford : Oxford University Press, 2002. - 255 p.

21. Molecular cell biology / H. Lodish, A. Berk, C.A. Kaiser et al. - New York : W.H. Freeman and Company, 2013. - 1211 p.

22. Pharmacogenomics / Ed. by W. Kalow, U.A. Meyer, R.F. Tyndale. - New York : Taylor & Francis, 2005. - 646 p.

23. Prediction of protein structures, functions, and interactions / Ed. by J.M. Bujnicki. - Chichester : Wiley, 2009. - 287 p.

24. Protein structure prediction: Methods and protocols / Ed. by D.M. Webster. - Totowa : Humana, 2000. - 415 p.

25. Selzer P.M. Applied bioinformatics: An introduction / P.M. Selzer, R.J. Marhöfer, A. Rohwer. - Berlin : Springer, 2008. - 287 p.

26. Voet D. Biochemistry / D. Voet, J.G. Voet. - Hoboken : Wiley, 2011. - 1487 p.

27. Young D.C. Computational drug design: A guide for computational and medicinal chemists / D.C. Young. - Hoboken : Wiley, 2009. - 307 p.

28. Бородовский М. Задачи и решения по анализу биологических последовательностей / М. Бородовский, С. Екишева. - М.-Ижевск : РХД, 2008. - 440 с.

29. Дромашко С.Е. Очерки биоинформатики / С.Е. Дромашко. - Минск : Беларуская навука, 2009. - 400 с.

30. Каменская М.А. Информационная биология / М.А. Каменская. - М. : Академия, 2006. - 368 с.

31. Корогодин В.И. Информация как основа жизни / В.И. Корогодин, В.Л. Корогодина. - Дубна : Изд. центр "Феникс", 2000. - 208 с.

32. Чернавский Д.С. Синергетика и информация. Динамическая теория информации / Д.С. Чернавский. - М. : Либроком, 2009. - 304 с.

Дополнительная

33. Bioinformatics: A practical guide to the analysis of genes and proteins / Ed. by A.D. Baxevanis, B.F.F Ouellette. - New York : Wiley, 2001. - 470 p.

34. Bioinformatics and drug discovery / Ed. by R.S. Larson. - New York : Humana Press, 2012. - 381 p.

35. Chou P.Y. Prediction of protein conformation / P.Y. Chou, U.D. Fasman // Biochemistry. - 1974. - V. 13. - P. 211-215.

36. Computational Biology / Ed. by D. Fenyo. - New York : Humana Press, 2010. -327 p.

37. Cotton J.A. Eukaryotic genes of archaebacterial origin are more important than the more numerous eubacterial genes, irrespective of function / J.A. Cotton, J.O. Mclnerney // PNAS. - 2010. - V. 107. - P. 17252-17255.

38. Edwards D. Bioinformatics: Tools and applications / D. Edwards, J. Stajich, D. Hansen. - New York : Springer, 2009. - 451 p.

39. Evans W.E. Pharmacogenomics: Translating functional genomics into rational therapeutics / W.E. Evans, M.V. Relling // Science. - 1999. - V.286, № 5439. - P. 487-491.

40. Gamier J. Analysis of the accuracy and implications of simple methods for predicting the secondary structure of globular proteins / J. Gamier, D.J. Osguthorpe, B. Robson // J. Mol. Biol. - 1978. - V. 120. - P. 97-120.

41. Griffiths J.F. An introduction to genetic analysis / J.F. Griffiths, S.R. Wessler, R.C. Lewontin et al. - New York : Freeman, 2005. - 706 p.

42. Henikoff S. Amino acid substitution matrices from protein blocks / S. Henikoff, J.G. Henikoff // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1992. - V.89. - P. 10915-10919.

43. Huson D.H. Phylogenetic networks - Concepts, algorithms and applications / D.H. Huson, R. Rupp, C. Scornavacca. - Cambridge : Cambridge University Press, 2011. - 362 p.

44. Marcus F.B. Bioinformatics and systems biology: Collaborative Research and Resources / F.B. Marcus. - Berlin : Springer, 2008. - 287 p.

45. Metropolis N. The Monte Carlo method / N. Metropolis, S. Ulam // Journal of the American Statistical Association. - 1949. - V. 44, №. 247. - P. 335-341.

46. Multiscale Approaches to Protein Modeling / Ed. by A. Kolinski. - New York : Springer, 2011. - 355 p.

47. Pharmacogenetics / Ed by I.P. Hall. - New York : Taylor & Francis, 2006. - 324 p.

48. Procter J.B. Visualization of multiple alignments, phylogenies and gene family evolution / J.B. Procter, J. Thompson, I. Letunic, [et al.] // Nature Methods.-2010.-V. 7,№3s.-P. 16-25.

49. Protein Data Bank. - Интернет-ресурс. - http://www.pdb.org/.

50. Ramsdcn J. Bioinformatics: An introduction / J. Ramsden. - Berlin : Springer, 2009. - 271 p.

51. Rost B. Bridging the protein sequence-structure gap by structure predictions / B. Rost, C. Sander // Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure. - 1996. - V. 25. - P. 113-136.

52. Setubal J. Introduction to computational molecular biology / J. Setubal, J. Meidanis. - Boston : Thomson, 1997. - 320 p.

53. Schneider T.D. Sequence logos: a new way to display consensus sequences / T.D. Schneider, R.M. Stephens // Nucleic Acids Research. - 1990. - V. 18, № 20. - P. 6097-6100.

54. Stephenson F.H. Calculations for molecular biology and biotechnology / F.H. Stephenson. - Amsterdam : Elsevier, 2003. - 302 p.

55. Tan P.T.J. Bioinformatics for venom and toxin sciences / P.T.J. Tan, A. M. Khan, V. Brusie // Briefings in Bioinformatics - 2003. - V.4, №1. - P. 53-62.

56. The 1000 Genomes project consortium. A map of human genome variation from population-scale sequencing // Nature. - 2010. - V. 467, № 7319. - P. 1061-1073.

57. Woolard P.M. The application of next-generation sequencing technologies to drug discovery and development / P.M. Woolard, N.A.L. Mehta, J.J. Va- mathrvan et al. // Drug Discovery Today. - 2011. - V. 16, № 11/12. - P. 56-63

58. Дурбин P. Анализ биологических последовательностей / P. Дурбин, Ш. Эдди, А. Крог, Г. Митчисон. - М.-Ижевск : РХД, 2006. - 480 с.

59. Игнасимуту С. Основы биоинформатики / С. Игнасимуту. - Ижевск : Институт компьютерных исследований, 2007. - 320 с.

60. Мёллер Г.Д. Избранные работы по генетике / Г.Д. Мёллер. - М.-Л. : Огиз-Сельхозгиз, 1937. - 350 с.

61. Тимофеев-Ресовский Н.В. О природе генных мутаций и структуре гена / Н.В. Тимофеев-Ресовский, Л.Г. Циммер, М. Дельбрюк / Н.В. Тимофеев-Ресовский. Избранные труды. - М. : Медицина, 1996. - С. 105-153.

62. Шеннон Л. Работы по теории информации и кибернетике / К. Шеннон, Е. Бандваген. - М. : Иностр. лит., 1963. - С. 667.

63. Шредингер Э. Что такое жизнь? Физический аспект живой клетки / Э. Шредингер. - М.-Ижевск : РХД, 2002. - 92 с.

64. Эйген М. Гиперцикл. Принципы самоорганизации макромолекул / М. Эйген, И. Шустер. - М. : Мир, 1982. - 270 с.

65. Винер Н. Кибернетика или управление и связь в животном и машине / Н. Винер. - М. : Советское радио, 1968. - 326 с.

66. Кондратьев В.Б. Глобальная фармацевтическая промышленность / B. Б. Кондратьев // Перспективы. - Электронный Интернет-ресурс.

http://www.perspectivy.info/ms/ekob/globalnaja_farmacevticheskaja_prom yshlennost_201 l-07-18.htm.

67. Биоинформатика - Bioinformatics - Prof. A.N. Ogurtsov. - Электронный Интернет-ресурс. - http://sites.google.com/site/anogurtsov/lectures/bi/.