Биохимия и молекулярная биология - Белясова Н.А. 2002

Метаболизм. Процессы, требующие притока энергии
Метаболизм азотсодержащих соединений
Фиксация азота и включение его в состав органических молекул

Молекулярный азот представляет собой чрезвычайно инертное соедине­ние, расщепление молекулы N₂ требует больших затрат энергии. Из всех на­селяющих Землю организмов ферментативную фиксацию азота осуществля­ют лишь некоторые прокариоты. Данный процесс в их клетках катализирует­ся нитрогеназной системой и осуществляется в процессе, который можно описать общим уравнением:

N₂ + 6H⁺ + 6з + 12 ATP → 2NH₃ + 12ADP + 12P;      (16.1)

Нитрогеназная система бактерий локализуется во впячиваниях плазмати­ческой мембраны и состоит из двух компонентов: железосерного белка (4Fe 4S^2-) и молибдоферредоксина (белок, содержащий молибден и железо). На одну молекулу молибдоферредоксина (MoFe) в активной нитрогеназной системе приходится 2 молекулы железосерного белка. Вспомогательными компонентами, участвующими в переносе электронов на нитрогеназную сис­тему, служат флавиновые кофакторы и ферредоксин. Роль первичного донора электронов в этом процессе обычно выполняет NADPH.

Процесс переноса электронов на молекулярный азот (рис. 16.2) осуществ­ляется следующим образом: донор электронов восстанавливает ферредоксин, который самостоятельно либо через флавин переносит электроны на железо­серные центры нитрогеназной системы. Затем АТР связывается с железосер­ными белками и сдвигает их окислительно-восстановительный потенциал с - 0,29 В до -0,4 В путем изменения конформации белка. Подобное увеличение восстановительной способности железосерных белков позволяет им перено­сить электроны на молибдоферредоксин. На следующей стадии гидролизуется АТР, восстанавливается MoFe и нитрогеназная система диссоциирует на компоненты. Считается, что перенос пары электронов от восстановленной формы железосерных белков к молибдоферредоксину сопряжен с гидролизом четырех молекул АТР.

Восстановление молибдоферредоксина связано с переходом атома молиб­дена из окисленного состояния Мо(VI) в восстановленное Мо(IV), от которого электроны переносятся непосредственно на N_2. Для полного восстановления молекулы азота до двух молекул NH₃ требуется три последовательных 2-электронных перехода, которые будут сопряжены с гидролизом 12 (4 х 3) молекул АТР.

На симбиотическую азотфиксацию, в которой кроме нитрогеназной сис­темы бактерий принимают участие и некоторые структуры растений, расходуется энергия, запасенная обоими организмами. Есть сведения, что в этом процессе потребляется до пятой части всей энергии, запасенной растением.

Нитрогеназная система восстанавливает не только молекулярный азот, но и ацетилен, азид, закись азота, цианид, нитриты и протоны. Перенос части восстановительных эквивалентов на Н⁺ осуществляется нитрогеназной систе­мой в побочной реакции, поэтому наряду с аммиаком при фиксации азота всегда образуется молекулярный водород.

Сильным ингибитором нитрогеназной системы является молекулярный кислород: в его присутствии основные компоненты системы быстро инакти­вируются. Поэтому фиксация азота осуществляется в анаэробных участках клеток. Например, у клубеньковых бактерий специальная форма гемоглобина (леггемоглобин) защищает нитрогеназную систему от молекулярного кисло­рода, а у цианобактерий эту роль выполняют стенки гетероцист.

Следующей стадией включения азота в состав органических молекул яв­ляется аминирование кетокислот, в результате которого возникают амино­кислоты. Наиболее распространено восстановительное аминирование кето­кислот. При этом основным продуктом, образующимся в данном процессе, является глутамат. Глутамат используется в качестве субстрата для включе­ния еще одной молекулы аммиака, в результате чего синтезируется глутамин (рис. 16.3).

Перечисленные выше реакции имеют особое значение в биосинтезе ами­нокислот, поскольку катализирующие их ферменты наиболее активны, в ре­зультате чего данные процессы превращаются в основные пути включения аммиачного азота в состав аминокислот. В ходе последующих превращений аминогруппы глутамата и глутамина включаются в состав большинства дру­гих аминокислот. Подобные реакции носят название реакций трансаминирования.

Рис. 16.2. Работа нитрогеназной системы прокариот при фиксации молекулярного азота (объяснения в тексте)

Рис. 16.3. Включение аммиака в состав аминокислот