Основы биохимии Том 1 - А. Ленинджер 1985

Биомолекулы
Вода
Классификация аминокислот на основе их R-групп

Рассмотрим теперь структуру 20 аминокислот, встречающихся в белках. Дело облегчается тем, что все аминокислоты можно сгруппировать на основе признаков, свойственных их R-группам. в частности их полярности (табл 5-3), т.е. способности R-групп к взаимодействию с водой при биологических значениях pH (вблизи pH 7,0). По степени полярности все R-группы аминокислот можно расположить в виде непрерывного ряда, начиная от полностью неполярных, или гидрофобных (т.е. водоотталкивающих), R-гpyпп и кончая сильно полярными, или гидрофильными («любящими») воду), R-группами.

Таблица 5-3. Классификация аминокислот в соответствии с полярностью их R-гpyпп (при pH 7)

Неполярны

е R-группы

Аланин

Валин

Изолейцин

Лейцин

Метионин

Пронин

Триптофан

Фенилаланин

Полярные, но незаряженные R-группы

Аспарагин

Глицин

Глутамин

Серин

Тирозин

Треонин

Цистеин

Отрицательно заряженные R-группы

Аспарагиновая кислота

Глутаминовая кислота


Положительно заряженные R-группы

Аргинин

Гистидин Лизин


Строение 20 стандартных аминокислот показано на рис. 5-6. Имеется четыре основных класса аминокислот, содержащих R-группы следующих типов: 1) неполярные, или гидрофобные, 2) полярные, но незаряженные, 3) отрицательно заряженные и 4) положительно заряженные. Внутри каждого класса имеется определенная градация по полярности, размерам и форме R-гpyпп.