ОСНОВЫ БИОХИМИИ ЛЕНИНДЖЕРА - ТОМ 3. ПУТИ ПЕРЕДАЧИ ИНФОРМАЦИИ - 2017

ЧАСТЬ III. ПУТИ ПЕРЕДАЧИ ИНФОРМАЦИИ

ПРИЛОЖЕНИЕ А.

Принятые в биохимии сокращения и аббревиатуры

 — ангстрем

А — аденин, аденозн или аденилат

А — абсорбция

Ab (АТ) — антитело

АВС — ATP-связывающая кассета

АСАТ — ацил-СоА-холестерин-ацилтрансфераза

АСС — ацетил-СоА-карбоксилаза

АСh (АХ) — ацетилхолин

АСР — ацилпереносящий белок

ACT (АКТГ) — адренокортикотропный гормон

acyl-CoA — ацил-производные кофермента А (или ацил-S-CoA)

ADH — алкогольдегидрогеназа

adoHcy — S-аденозилгомоцистеин

adoMet — S-аденозилметионин (SAM)

AFM (ACM) — атомно-силовая микроскопия

Ag (АГ) — антиген

AGE — конечный продукт гликирования

AIDS (СПИД) — синдром приобретенного иммунодефицита

АКАР — белок, заякоривающий киназу А

Ala — аланин

[a]D²⁵°C -удельное (оптическое) вращение

AMP, ADP, АТР — аденозин-5'-моно-, -ди-, -трифосфат

АМРК — AMP-активируемая протеинкиназа

ANF — атриальный натрийуретический фактор

AQP — аквапорин

Arg — аргинин

ARS автономно реплицирующаяся последовательность

Asn — аспарагин

Asp — аспарагиновая кислота (аспартат)

ATCase — аспартаттранскарбамоилаза

atm (атм) — атмосфера

ATPase (АТРаза) — аденозинтрифосфатаза

В₁₂ — кофермент В₁₂, кобаламин

ВАС — искуственная бактериальная хромосома

ВАТ — бурая жировая ткань

BMR — базовый уровень метаболизма

bр (п. н.) — пары нуклеотидов

1,3-BPG (1,3-БФГ) — 1,3-бисфосфоглицерат

С — цитозин, цитидин или цитидилат

САМ — метаболизм органических кислот по типу толстянковых

СаМ — кальмодулин

сАМР — циклический 3',5'-АМР

CD (КД) — круговой дихроизм

CDK — циклинзависимая протеинкиназа

cDNA (кДНК) — комплементарная ДНК

CFTR -белок-регулятор мембранной проводимости хлорных каналов

cGMP — циклический 3',5'-GMP

Chl (Хлф) — хлорофилл

ChREBP — белок, связывающий углевод-чувствительный элемент (фактор транскрипции)

СКII — казеинкиназа II

CL — кардиолипин

CMP, CDP, СТР — цитидин-5'-моно-, -ди-, -трифосфат

СоА — кофермент A (CoASH)

СОНb — карбоксигемоглобин

CoQ — кофермент Q (убихинон, UQ)

СОХ — циклооксигеназа; цитохромоксидаза

CREB — белок, связывающий сАМР-чувствительный элемент (фактор транскрипции)

CRP — сАМР-рецепторный белок

Cys — цистеин

Cyt — цитохром

D — дигидроуридин

D — коэффициент диффузии

d(р)— плотность

dADP, dGDP и т. д. — дезоксиаденозин-5'-дифосфат, дезоксигуанозин-5'-дифосфат и т. д.

dAMP, dGMP и т. д. — дезоксиаденозин-5'-моно- фосфат, дезоксигуанозин-5'-монофосфат и т. д.

dATP, dGTP и т. д. — дезоксиаденозин-5'-трифосфат, дезоксигуанозин-5'-трифосфат и т. д.

DEAE — диэтиламиноэтил

DFP — диизопропилфлуорофосфат (DIFP)

DHAP — дигидроксиаценонфосфат

DHF — дигидрофолат (Н₂-фолат)

DMS — диметилсульфат

DNA — дезоксирибонуклеиновая кислота

Dnase (ДНКаза) — дезоксирибонуклеаза

DNP (ДНФ) — 2,4-динитрофенол

Dol — долихол

dopa (дофа) — дигидроксифенилаланин

Е — электрическй потенциал

Е.С. — Комиссия по ферментама (после номера фермента по его формальной классификации)

ЕСМ — внеклеточный матрикс

EDTA (ЭДТА) — этилендиаминтетраацетат

EF — фактор элонгации

EGF — эпидермальный фактор роста

ELISA (ИФА) — иммунофлуоресцентный анализ

ЕМ (ЭМ) — электронная микроскопия

emf (эдс) — электродвижущая сила

ЕРО — эритропоэтин

ε — молярный коэффициент абсорбции

ER (ЭР) — эндоплазматический ретикулум

EST — метка экспрессируемой последовательности

ɳ — вязкость

F (Ф) — фарад

f — коэффициент трения

FA (ЖК) - жирная кислота

G6PD — глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа

FAD (ФАД), FADH2 (ФАДН₂) — флавинадениндину- клеотид и его восстановленная форма

FAS — синтеза жирных кислот

FBPase-1 фруктозо-1,6-бисфосфатаза

FBPase-2 — фруктозо-2,6-бисфосфатаза

Fd (Фд) — ферредоксин

FDNB (DNFB) — 1-фтор-2,4-динитробензол

F0F1 — митохондриальная АТР-синтаза

FFA (СЖК) — свободная (неэтерифицированная) жирная кислота

FH (СГ) — семейная гиперхолестеринемия

fMet — N-формилметионин

FMN, FMNH₂(ФМН, ФМН • Н₂) — флавинмононуклеотид и его восстановленная форма

FOXO1 — фактор транскрипции; от англ. forkhead box O1

FP — флавопротеин

F1P — фруктозо-1-фосфат

F6P — фруктозо-6-фосфат

FRAP — восстановление флуоресценции после фотовыцветания

FRET — резонансный перенос энергии флуоресценции

Fru — D-фруктоза

∆G — изменение свободной энергии

∆G° — изменение стандартной свободной энергии

∆G'° — изменение приведенной стандартной свободной энергии в биоимических стандартных состояниях

∆G* — энергия активации

∆G_B— энергия связывания

∆G_p— изменение свободной энергии гидролиза АТР (потенциал фосфорилирования) во внутриклеточных условиях

G — гуанин, гуанозин или гуанилат

g — ускорение свободного падения

GABA (ГАМК) — y-аминомасляная кислота

Gal — D-галактоза

GalN — D-галактозамин

GalNAc — N-ацетил-D-галактозамин

GAP — глицеральдегид-3-фосфат; белок-активатор GTPaзы

GDH — глутаматдегидрогеназа

GEF — фактор обмена гуаниновых нуклеотидов

GFP — зеленый флуоресцентный белок

GH (ГР) гормон роста

GHB — гликированный гемоглобиин

GLC (ГЖХ) — газожидкостная хроматография

Glc — D-глюкоза

GlcA — D-глюконовая кислота

GlcN — D-глюкозамин

GlcNAc — N-ацетил-D-глюкозамин (NAG)

GlcUA — D-глюкуроновая кислота

Gln — глутамин

Glu — глутаминовая кислота, глутамат

GLUT — транспортер глюкозы

Gly — глицин

GMP, GDP, GTP — гуанозин-5'-моно, -ди-, трифосфат

GPCR — рецептор, сопряженный с G-белком

GPI — гликозилированное производное фосфатидилинозита

G1P — глюкозо-1-фосфат

G6P — глюкозо-6-фосфат

GRK — киназа, сопряженная с G-белком

GSH, GSSG — глутатион и его окисленная форма

GSK3 — киназа 3-гликогенсинтазы

∆Н — изменение энтальпии

НА — белок гемагглютинин

Hb, HbO₂— гемоглобин, оксигемоглобин, окисленный гемоглобин

HDL (ЛПВП) липопротеины высокой плотности

Н₂folate (Н₂-фолат) — дигидрофолат (DHF)

Н₄folate (Н₄-фолат) — тетрагидрофолат (THF)

HIF — индуцируемый гипоксией транскрипционный фактор

His — гистидин

HIV (ВИЧ) — вирус иммунодефицита человека

HMG-CoA — β-гидрокси-β-метилглутарил-СоА

hnRNA (гяРНК) гетерогенная ядерная РНК

HPLC (ВЭЖХ) — высокоэффективная жидкостная хроматография

HRE — элемент гормонального ответа (гормон-чувствительный элемент)

Hsp — белок теплового шока

НТН — спираль-поворот-спираль

Нур — гидроксипролин

I — инозин

IF — фактор инициации

Ig (ИГ) — иммуноглобулин (антитело)

IgG — иммуноглобулин G

Ile — изолейцин

IMP, IDP, ITP — инозин-5'-моно-, -ди-, -трифосфат

IР₃ — инозит-1,4,5-трифосфат

IR (ИК) — инфракрасный

IRP — железо-регуляторный белок

IRS-1, IRS-2 — субстрат-1 и субстрат-2 инсулинового рецептора

IS (IS-элемент) — инсерционная последовательность

J (Дж) - джоуль

JAK — Янус-киназа

Кa — константа диссоциации кислоты

Kd — константа диссоциации

K_D — константа диффузии

Ke_q — константа равновесия

K′_eq — константа равновесия в стандартных условиях

КI — константа ингибирования

К_м — константа Михаэлиса

k — константа скорости

k_cat — число оборотов

kb — тысячи [пар] нуклеотидов, килобазы

kbp (т. п. н.) — тысячи пар нуклеотидов

α-KG — α-кетоглутарат

lac — лактоза

λ — длина волны

LDH (ЛДГ) — лактатдегидрогеназа

LDL (ЛПНП) — липопротеин низкой плотности

Leu — лейцин

LH (ЛГ) — лютеинизирующий гормон

LHC — светопоглощающий комплекс

Lk — порядок зацепления

In — логарифм по основанию е

lg — логарифм по основанию 10

LT — лейкотриен

LTR — длинный концевой повтор

Lys — лизин

Мr — относительная молекулярная масса

Man — D-манноза

МАРК — митоген-активируемые протеинкиназы

Mb, MbO₂ — миоглобин, оксимиоглобин, окисленный миоглобин

MCAD — ацил-СоА-дегидрогеназа средних цепей

МСМ — белки поддержания минтхромосом

mDNA (мДНК) — митохондриальная ДНК

Met — метионин

MFP — мультифункциональный белок (в окислении жирных кислот)

miRNA — микроРНК

MODY — диабет взрослого типа у молодых

mRNA (мРНК) — матричная РНК

MS (МС) — масс-спектроскопия

MSH (МСГ) — меланоцит-стимулирующий гормон

μ — электрофоретическая подвижность

Mur — мурамовая кислота

Mur2Ac — N-ацетилмурамовая кислота (NAM)

NAD⁺, NADH — никотинамидадениндинуклеотид и его восстановленная форма

NADP⁺, NADPH — никотинамидадениндинуклеотид- фосфат и его восстановленная форма

NAG — N-ацетилглюкозамин (GlcNAc)

NAM — N-ацетилмурамовая кислота (Mur2Ac)

ncRNA (нкРНК) — некодирующая РНК

Neu5Ac — N-ацетилнейраминовая кислота (сиаловая кислота)

NMN⁺, NMNH — никотинамидмононуклеотид и его восстановленная форма

NMP, NDP, NTP — нуклеозидмоно-, -ди-, -трифосфат

NMR (ЯМР) — ядерный магнитный резонанс

NО — оксид азота

ОАА — оксалоацетат

ORC — комплекс распознавания точки инициации репликации

ORF — открытая рамка считывания

Р — давление

P_i — неорганический фосфат

РАВ или РАВА (ПАБК) — n-аминобензоат (парааминобензойная кислота)

PAGE — электрофорез в полиакриламидном геле

PC — пластоцианин; фосфатидилхолин

PCR (ПЦР) — полимеразная цепная реакция

PDB — Protein Data Bank (база данных белков)

PDE — фосфодиэстераза циклических нуклеотидов

PDH (ПД) — пируватдегидрогеназа

РЕ — фосфатидилэтаноламин

РЕР (ФЕП) — фосфоенолпируват

РЕРСК — фосфоенолпируваткарбоксикиназа

РЕТ (ПЭТ) — позитронная эмисионная томография

PFK (ФФК) — фосфофруктокиназа

PG (ПГ) — простагландин

2PGA (2ФГ) — 2-фосфоглицерат

3PGA (ЗФГ) 3-фосфоглицерат

pH — lg(l/[H⁺])

Phe — фенилаланин

PI — фосфатидилинозит

pI — изоэлектрическая точка

РIР₂ — фосфатидилинозит-4,5-бисфосфат

РК (ПК) — протеинкиназа; пируваткиназа

pK — lg(1/K)

РКА — сАМР-зависимая протеинкиназа (протеинкиназа А)

РКВ — протеинкиназа В (Akt)

РКС — Са²⁺/кальмодулин-зависимая протеинкиназа (протеинкиназа С)

PKG — cGMP-зависимая протеинкиназа (протеинкиназа G)

PKU (ФКУ)- фенилкетонурия

PLC — фосфолипаза С

PLP — пиридоксаль-5-фосфат

рO₂ — парциальное давление кислорода

Pol — полимераза (ДНК или РНК)

PP_i — неорганический пирофосфат

РР1 (ФПФаза 1) — фосфопротеинфосфатаза 1

PPAR — рецептор, активируемый пролифератором пероксисомы

PQ (ПХ) — пластохинон

pRb — белок ретинобластомы

Pro — пролин

PRPP — 5-фосфорибозил-1-пирофосфат

PS (ФС) — фосфатидилсерин; фотосистема

∆Ψ — трансмембранный электрический потенциал

РТВ — фосфотирозиновое связывание

PUFA (ПНЖК) — полиненасыщенная жирная кислота

Q — отношение действующих масс

Q, QH₂ — убихинон, восстановленный убихинон

Rb — ген ретинобластомы (ген опухолевого супрессора)

RC — фотореакционный центр

RER (ШЭР) — шероховатый эндоплазматический ретикулум

RF — релизинг-фактор; репликативная форма

RFLP — полиморфизмы длины фрагментов рестрикции

RGS — регулятор сигнала G-белка

RIA (РИА) — радиоиммунный анализ

Rib — D-рибоза

RLK — рецептороподобная протеинкиназа

RNA (РНК) — рибонуклеиновая кислота

RNAi (РНКи) — интерференция РНК

RNase (РНКаза) рибонуклеаза

ROS — активные формы кислорода (АФК); наружный сегмент палочки (сетчатка)

rRNA (рРНК) — рибосомная РНК

RSV — вирус саркомы Рауса

RTK — рецептор тирозинкиназы (рецептор Туr- киназы)

∆S — изменение энтропии

SAM — S-аденозилметионин (adoMet)

SDS — додецилсульфат натрия

SELEX — систематическая эволюция лигандов путем экспоненциального обогащения

SER (ГЭР) — гладкий эндоплазматический ретикулум

Ser — серин

SERCA — кальциевая АТРаза саркоплазматического и эндоплазматического ретикулумов

SMC — белки, поддерживающие структуру хромосом

SNARE — растворимый рецептор связывания N-этилмалеимид-чувствительного фактора

snoRNA (мякРНК) — малая ядрышковая РНК

STP — однонуклеотидный полиморфизм

snRNA (мяРНК) — малая ядерная РНК

snRNP (мяРНП) — малый ядерный рибонуклеопротеин

SREBP — белки, взаимодействующие со стерол-регулируемым элементом

sRNA (маРНК) - малая РНК SRP — сигнал-распознающая частица

STAT — преобразователь сигнала и активатор транскрипции

STP — стандартные температура и давление

STR — короткий тандемный повтор

stRNA (мвРНК) — малая временная РНК

STS — последовательно-меченные сайты

SUR — рецептор сульфонилмочевины

Т — тимин, тимидин или тимидилат

Т — абсолютная температура

T2DM (ИНЗСД) — сахарный диабет 2-го типа (инсулиннезависимый)

ТВР — ТАТА-связывающий белок

ТСА (ТКК) — трикарбоновая кислота

TFP - трифункциональный белок

THF (ТГФ) — тетрагидрофолат (Н4-фолат)

Thr — треонин

TLC (ТСХ) — тонкослойная хроматография

TMP, TDP, ТТР — тимидин-5'-моно, -ди-, -трифосфат

TMV (ВТМ) — вирус табачной мозаики

TPI — триозофосфатизомераза

ТРР — тиаминпирофосфат

tRNA (тРНК) — транспортная РНК

Тrр — триптофан

ТХ — тромбоксан

Туr — тирозин

U — урацил, уридин или уридилат

UAS — активирующая последовательность

UCP — разобщающий белок

UDP-Gal — уридиндифосфатгалактоза (UDP- галактоза)

UDP-Glc — уридиндифосфатглюкоза (UDP- глюкоза)

UMP, UDP, UTP — уридин-5'-моно-, -ди-, -трифосфат

UQ- убихинон (кофермент Q; CoQ)

UV (УФ) — ультрафиолет

V_m— трансмембранный электрический потенциал (мембранный потенциал)

_Vmax — максимальная скорость

_V0 — начальная скорость

Val — валин

VDR — рецептор витамина D

VEGF — фактор роста эндотелия сосудов

VLDL (ЛПОНП) — липопротеин очень низкой плотности

WAT — белая жировая ткань

YAC — искуственная дрожжевая хромосома

Z — суммарный заряд