Биохимия - Химические реакции в живой клетке Том 3 - Д. Мецлер 1980

Конструирование молекулярных моделей
Картонные модели

Многие биологические «макромолекулы» типа белков или нуклеиновых кислот состоят из такого огромного количества атомов, что сборка их модели из отдельных шариков и трудоемка, и дорога. В таких случаях прибегают к макетам из картона (металла или пластмассы). Например, для изображения планарной пептидной единицы можно сделать макет (рис. П-1), исходя из размеров, приведенных на рис. 2-3 (т. 1, стр. 88). Довольно сложно рассчитать угол, под которым следует делать сгибы для воспроизведения углов — и ψ (см. рис. 2-4 и табл. 2-3). (Гораздо легче решить эту задачу непосредственно путем геометрического конструирования, используя кусочки картона.) Таким способом можно создать очень красивые спиральные структуры (некоторые примеры приводит Карлсон [1]). При необходимости к а-углеродным атомам можно приклеить пенопластовые боковые цепи. При этом можно расположить спиральную модель на поверхности картонного цилиндра и украсить пенопластовыми боковыми цепочками.

РИС. П-1. Образец для изготовления картонных моделей полипептидов. Масштаб 2 см : 0,1 нм.

Для конструирования спиралей ДНК и РНК плоские пары оснований, сделанные из картона (а еще лучше — из более плотного материала), нанизывают на проволоку, изображающую ось, а в качестве распорок используют кусочки резиновой или полиэтиленовой трубки. Для изображения сахарофосфатного остова можно взять бумажные макеты или модели из шаров и палочек. (Для большей наглядности сахарофосфатный скелет можно сделать из двух полос плотной бумаги разного цвета.) Точная геометрия пар оснований приведена у Арнотта и Хьюкинса [2].

1. Karlson Р., Introduction to Modern Biochemistry, 3-rd ed., pp. 43—45, Academic Press, 1967. (Внимание: в 4-м издании приводится модель другого типа.)

2. Arnott S., Hukins D. W. L., JMB, 81, 93—105 (1975).